哈伊尔?戈尔巴乔夫期间辞去他在情报机构的职位。
    1991年普京担任列宁格勒市国际联络委员会主席，主管市政府的对外经济关系。他在工作中所表现的才干，受到同事好评。1994年3月，普京晋升为圣彼得堡市第一副市长，兼任国际联络委员会主席。他是索布恰克的左膀右臂，深受重用。索布恰克不论去哪里，都把他带在身边，普京因此获得“灰色大主教”之雅号。
    1996年索布恰克在市长选举中落选，副市长雅科夫列夫当选市长。普京不愿留在圣彼得堡工作，通过自己的同乡、当时担任叶利钦总统办公厅主任的丘拜斯来到莫斯科任职。1997年初普京出任俄罗斯总统办公厅总务局副局长，主管法律和对外经济联系问题。3个月后调任总统办公厅监察总局局长。不久又晋升为总统办公厅第一副主任，分管地方经济，与各地方领导人打交道，检查地方对外经济关系状况，特别是监查他们如何使用中央提供的贷款。
    1998年3月29日，叶利钦解除俄罗斯联邦安全会议秘书博尔久扎的职务，任命普京接任。4个月后，7月25日，叶利钦又任命普京兼任俄罗斯联邦安全委员会（前身克格勃）主席。当基里延科总理在克格勃总部为普京上任举行简短仪式时，普京满怀激情地说：“我回到了娘家。”8年前他离开克格勃开始从政，现在政治又把他送回到克格勃总部。
    1999年9月9日，普京被委任为三位俄罗斯总理候补之一。在此之后，前一届总理领导的政府倒台，

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