，几乎每时每刻都在思考着哲学问题。他陆续写出了系统神学著作《基督教神学》、《是与否》、《神学导论》和伦理学作品《认识你自己》等几部著作。他的声望和博学为他敞开了一个闻所未闻的世界，大量年轻人追随着他，并成为他思想的信徒。但是，这也招致了诸多批评，尤其是西多会的修道院长圣伯尔纳对他的攻击最激烈。而这位西多会的修道院长就是那位曾经对圣灵教堂的阿伯拉尔进行严酷迫害的克莱尔沃教会的伯尔纳。他仿佛注定要与阿伯拉尔为敌，决一死战。
    特别是阿伯拉尔的那本道德哲学的代表著作《认识你自己》问世后。招到了教会方面更为严厉的批评。在书中，他认为罪恶的产生．主要是在于意图而非行动；没有一个行动（甚至是杀人）其本身是有罪的。所以一个母亲，因其婴儿穿衣太少无法温暖时，紧紧地把婴儿抱在怀中，结果无心地使婴儿窒息而死。她杀死了她所爱的，虽然她受到法律的制裁，以使其他妇女提高警觉，但在上帝眼前她仍是清白的。更深一层来说，要构成一个罪行，须行为者不仅是触犯了别人，更重要的是违背了其自身的道德良心。因此杀害基督教的殉道者，对于罗马人并非是罪，因为他们相信这样的迫害，对保存他们的国家或是他们信仰的宗教来说都是必要的。不但如此，而且“甚至那些迫害其所认为有责任去加以迫害的基督以及他的跟从者的人，其行为固然被认为是有罪的，但假若他们违背良心，释放基督徒，则所犯的错误及罪行将是更大的。”这种解释即使合乎逻辑，也是使

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