皆便入汉军上三旗，封郑克塽为汉军正黄旗海澄公，而施琅也随同回到京城诉职，向玄烨直陈留守台湾之重要，玄烨采纳施琅的意见。康熙二十三年四月，清廷正式设台湾府县官，隶属于福建省管理，台湾之事至此完结，南方领土尽数收回。